转化医学国家重大科技基础设施(上海)开展新冠肺炎攻关取得重大研究成果-中新社上海

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转化医学国家重大科技基础设施(上海)开展新冠肺炎攻关取得重大研究成果-中新社上海
中新网上海新闻5月21日电 2019年12月,新式冠状病毒性肺炎(COVID-19)爆发。正在瑞金医院建设中的转化医学国家严峻科技根底设备(以下简称设备),与复旦大学隶属上海市公共卫生临床中心(以下简称公卫中心)、上海血液学研讨所、医学基因组学国家重点实验室、瑞金医院临床病毒学实验室,复旦大学上海医学院分子病毒实验室、上海交通大学医学院隶属同仁医院、中科院植物生理生态研讨所、上海巴斯德研讨所和上海养分与健康研讨所等单位通力协作,就新式冠状病毒基因组、分子流行病学特色、疾病临床特征进行了深入研讨。  5月20日,《天然》杂志在线全文宣布了该项研讨成果“Viral and host factors related to the clinic outcome of COVID-2019”(论文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2355-0)。  根据WHO最新计算,到2020年5月18日,全世界累计确诊患者超越460万,累计逝世病例超31万。在新式冠状病毒感染要害时刻,设备学术委员会主任、上海交通大学医学院隶属瑞金医院终身教授陈竺院士亲身进行布置和辅导,由设备主任陈赛娟院士亲身安排,敏捷建立严峻疾病基因组研讨渠道的精干研讨小组。由渠道负责人,曾参加过17年前SARS病毒基因组研讨的王升跃研讨员和刘峰博士、谭云博士、吕纲助理研讨员等组成。在瑞金医院宁光院长的大力支持下,与公卫中心研讨团队严密协作,对该中心在2020年1月20日-2月25日期间收治的326例患者,进行了病毒基因组、临床表现特色、免疫反响改动等数据的全面深度剖析。自1月27日(大年初三)收到榜首批样本起,严峻疾病基因组研讨渠道在一个多月时刻内完成了112个COVID-19病例的病毒基因组深度测序、拼装和解析。  病毒基因组序列进化树剖析标明SARS-CoV-2主要有两个分支(Clade I 和Clade II)。承认有华南海鲜商场触摸史的6位患者均会集在其中一个分枝中(Clade I),而Clade II患者无该触摸史,提示疫情发作并不局限于华南海鲜商场。经过对疫情爆发的不一起刻阶段和不同区域患者的SARS-CoV-2基因序列(截止2020年3月初)改动特征的比较剖析,从上海病例别离的病毒基因组中共识别了169个碱基改动,其重复出现的骤变与已发布的病毒序列一起,出现较为安稳的进化进程,显现该病毒可能在疫情前期就已适应在人类宿主中传达。一起发现, SARS-CoV-2两个分支的传达性、致病性和临床表现等方面无显着差异,未发现与COVID-19重症患者有显着相关的病毒变异序列。  从临床和免疫学研讨发现,COVID-19患者淋巴细胞显着削减,尤其是重症患者CD4+和CD8+ T细胞呈显着进行性下降趋势,且炎性细胞因子IL-6和IL-8显着增高。COVID-19疾病开展严峻程度的决定要素主要与患者年纪、根底疾病、淋巴细胞削减和相关的细胞因子风暴密切相关,这些要素成为疾病向重症改变的要害预警因子。根据上述临床剖析采纳前期针对性干涉办法,将有助于阻挠疾病向重症开展。  研讨团队向我国国家组学数据百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) (http://www.biosino.org/node)、全球流感序列数据库(GISAID)和NCBI的世界序列数据库(SRA)递交了112个病例的SARS-CoV-2基因组高质量序列数据。一起,设备也搭建了严峻疾病大数据渠道SARS-CoV-2 基因组数据交互式、开源在线剖析网站(http://ncov.linc.org.cn/)。相关研讨数据正在为国内外研讨单位和科学家同享。这关于进一步认清SARS-CoV-2的分子流行病特征、疾病发作开展特性,为重症患者前期确诊和医治,以及为药物和疫苗研制供给了重要的参阅根据,为终究打败SARS-CoV-2,维护全人类生命安全做出重要的奉献。  该论文的一起榜首作者为上海市公共卫生临床中心张小楠研讨员,凌云副主任,易志刚研讨员,转化医学国家严峻科技根底设备(上海)谭云博士、刘峰博士和吕纲助理研讨员。一起通讯作者为上海市公卫中心卢洪洲教授、设备主任陈赛娟院士和严峻疾病基因组学研讨渠道负责人王升跃研讨员。 注:请在转载文章内容时必须注明出处! 修改:陈静

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